Durant la neteja, s'han d'utilitzar agents de neteja especials i un drap suau per netejar suaument els forats de la malla del corró anilox per evitar que els objectes durs danyin la seva delicada estructura. L'eliminació de la pols a la superfície del cos de la màquina, els rails de guia i els ports de dissipació de calor del servomotor també és fonamental per garantir una dissipació suau de la calor i un moviment mecànic estable. El manteniment de la lubricació ha de seguir estrictament les especificacions de l'equip i afegir regularment el greix especificat als rails de guia, coixinets i altres components per reduir la pèrdua per fricció i mantenir la precisió a llarg termini de la màquina d'impressió flexogràfica. A més, les inspeccions diàries del segellat de les canonades pneumàtiques i l'acumulació de pols als armaris elèctrics poden prevenir eficaçment fallades sobtades.

L'estabilitat del sistema de la màquina d'impressió flexogràfica depèn del manteniment dual del maquinari i el programari. Tot i que l'estructura de transmissió sense engranatges simplifica la complexitat mecànica, encara cal comprovar regularment l'estanquitat del servomotor i la tensió de la corretja síncrona per evitar afluixaments i desviacions de registre. Pel que fa al sistema de control, cal supervisar els paràmetres del servomotor en temps real i calibrar el sistema de registre. La sensibilitat del sensor de tensió i del dispositiu d'adsorció al buit afecta directament la transmissió del material, i la neteja diària i les proves funcionals són essencials. En l'ús a llarg termini, la gestió dels consumibles de la impressora flexogràfica és igualment important, com ara la substitució oportuna de les fulles raspadores i els tubs de tinta envellits, i la còpia de seguretat regular dels paràmetres de l'equip per fer front a les anomalies de dades. El control de la temperatura i la humitat de l'entorn del taller pot reduir la deformació del material i la interferència electrostàtica, i optimitzar encara més l'efecte d'impressió. Només mitjançant estratègies de manteniment científiques i sistemàtiques, les premses d'impressió flexogràfiques poden continuar exercint els seus avantatges d'alta precisió i alta eficiència, alhora que mantenen els esforços per facilitar l'optimització estructural i l'avanç tecnològic dins de l'ecosistema industrial d'impressió i envasos.